Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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