Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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