Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms