Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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