Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms