Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms