Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms