Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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