Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi2Q920Q6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms