Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Thoc3Q8VE80 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Thoc3Q8VE80 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms