Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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