Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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