Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tshz3Q8CGV9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms