Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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