Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc9Q8CDN9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms