Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacnb2Q8CC27 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacnb2Q8CC27 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms