Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf428Q8C1M2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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