Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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