Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms