Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Susd6Q8BGE4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Susd6Q8BGE4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms