Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms