Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll4Q80UG8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll4Q80UG8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms