Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp8Q80U87 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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