Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms