Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms