Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms