Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms