Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms