Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1cQ76I25 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms