Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms