Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms