Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms