Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim27Q62158 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim27Q62158 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim27Q62158 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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