Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms