Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms