Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nr2f1Q60632 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nr2f1Q60632 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nr2f1Q60632 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms