Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Bbs12Q5SUD9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms