Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms