Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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