Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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