Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms