Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UPC7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms