Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc4Q3UP44 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms