Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms