Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Puf60Q3UEB3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Puf60Q3UEB3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms