Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf149Q3U2C5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf149Q3U2C5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf149Q3U2C5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf149Q3U2C5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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