Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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