Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vax1Q2NKI2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms