Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cers3Q1A3B0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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