Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms